Особенность работы художника – «фиксация конкретного состояния души», постоянное духовное движение, воплощение в творчестве собственного мировоззрения, вызов зрителя на диалог. За годы творчества Геннадий Манжаев создал серии произведений живописи, графики и скульптуры, экспериментировал в техниках коллажа и лоскутного шитья, резьбы по дереву и выжигания на холсте. 

Своим «золотым запасом» сам Геннадий Манжаев называл тему православия: художник отмечал, что изображения святых ликов для него – попытка создать не икону, но умозрительный портрет, сохраняющий символическую и смысловую причастность к иконописному канону; это – его индивидуальное понимание святости, преображения самого человеческого существа путем праведной жизни и непоколебимого следования вере. Пастельные туманные пейзажи, существующие на зыбкой границе мирского и сакрального, озаряются внутренним светом ликов святых.